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基因組DNA的提取
DNA是遺傳信息的載體,是zui重要的生物信息分子,是分子生物學(xué)研究的主要對(duì)象,因此DNA的提取也應(yīng)是分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的zui重要、zui基本的操作,如不能有效的完成DNA提取方面的工作,那就根本談不上進(jìn)行分子生物學(xué)方面的實(shí)驗(yàn)。
在DNA提取過(guò)程中應(yīng)做到1,根據(jù)不同研究需要,保證結(jié)構(gòu)的相應(yīng)完整性;2,盡量排除其它大分子成分的污染(蛋白質(zhì)、多糖及RNA等);3,保證提取樣品中不含對(duì)酶有抑制作用的有機(jī)溶劑及高濃度的金屬離子。下面結(jié)合不同的研究對(duì)象列出幾種相應(yīng)的DNA提取方法。
方法1,總DNA的大量提取
本方法通過(guò)液氮研磨粉碎動(dòng)植物組織、裂解液裂解細(xì)胞、有機(jī)溶劑抽提,使進(jìn)入水相的核酸與蛋白成分分開,在RNA酶作用下,降解RNA,得純度較高的DNA樣品。
一:儀器 高速冷凍離心機(jī)、臺(tái)式離心機(jī)、恒溫水浴、低溫冰箱或冰柜、冷凍真空干燥器、取液器、電泳儀、水平電泳槽、紫外觀測(cè)儀
二:試劑 細(xì)胞裂解液(100mM Tris-HCl 5mM EDTA 500mM NaCl 1% SDS pH 7.5);飽和酚;/異戊醇;異丙醇;70%及無(wú)水乙醇;3M NaAC(pH5.2);RNA酶;TAE緩沖液;載樣緩沖液
三:操作 動(dòng)植物材料10g(鮮組織) 0.5g(干凍組織)
液氮,研碎
10ml裂解液(含1/10體積酚),(65℃預(yù)熱),
加入等體積, 65℃放置30分鐘,
間隔5-10min輕搖一次,
離心(12000-15000rpm, 15min )
上清液
靜止下
0.6體積冷異丙醇,
0.1體積3MpH5,2乙酸鈉,
挑取絮狀體, 70%冷乙醇洗滌,真空干燥,
2mlTE(或水)+10ulRNase,65℃,10-30分復(fù)溶和除RNA
等體積酚/抽提
(輕輕混勻、冰浴沉淀5min,5000RPM離心5min,取上清)
上清液
2V無(wú)水乙醇、1/10VnaAC,
-20,2或-80℃,30min
10000RPM,10min
沉 淀
70%冷乙醇洗滌
真空干燥
干粉-20℃保存,
或復(fù)溶于0.5-1mlTE或水中,分裝成小體積, -20℃或4℃保存
四:鑒定
所提DNA進(jìn)行Agarose膠分析(電泳過(guò)程見附),紫外觀測(cè)儀觀測(cè),凝膠成像系統(tǒng)拍攝。
注意:
1,裂解液要預(yù)熱,以抑制DNase,加速蛋白變性,促進(jìn)DNA溶解
2,酚一定要堿平衡
3,各操作步驟要輕柔,盡量減少DNA的人為降解
4,取各上清時(shí),不應(yīng)貪多,以防非核酸類成分干擾.
5,異丙醇,乙醇.NaAC,KAC等要預(yù)冷,以減少DNA的降解,促進(jìn)DNA與蛋白等的分相及DNA沉淀。
6,本方法適用于以DNA片段的酶切分析、Southern印跡等中,具有快速、省時(shí)、省線的特點(diǎn)。
7,此方法也適合菌類DNA的大量提取。
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