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N15和C13標(biāo)記重組蛋白的制備
隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)學(xué)和蛋白質(zhì)組織代謝學(xué)開始飛速的發(fā)展,特別是近些年NMR(nuclear magnetic resonance)技術(shù)在蛋白結(jié)構(gòu)分析領(lǐng)域逐漸成熟,使蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)分析變得簡單易行。 NMR分析蛋白結(jié)構(gòu)的基本原理是利用核質(zhì)譜儀發(fā)出一系列的電磁波,激發(fā)蛋白中的H、N、C原子,使H、N、C這些原子從基態(tài)轉(zhuǎn)變成不穩(wěn)定的激發(fā)態(tài),當(dāng)電磁波發(fā)射完畢后,激發(fā)態(tài)的原子會自動恢復(fù)到基態(tài),多余的能量就釋放出去,通過收集這些能量信息,做進(jìn)一步的分析便能得到蛋白的原子結(jié)構(gòu),畫出蛋白的三維結(jié)構(gòu)圖。 NMR技術(shù)雖然操作簡單,但是需要組成蛋白的H、N、C原子具有共振性,H具有天然的共振性可以分析10KD以下的蛋白,常規(guī)蛋白中含有的N14和C12不具有共振性,需要采用他們的同位素來代替。N15和C13屬于穩(wěn)定同位素不具有放射性,是目前取代常規(guī)蛋白中N14和C12代替物,所以我們在做蛋白結(jié)構(gòu)NMR分析過程中,zui為重要的方面還是在大量 N15和C13標(biāo)記蛋白的獲得。
蛋白質(zhì)獲得的方式有很多種,但是要獲取大量的目標(biāo)蛋白,仍然需要通過重組蛋白生物合成途徑,一方面容易控制生產(chǎn)條件,另一方面目標(biāo)蛋白的產(chǎn)量和質(zhì)量能夠得到保障。重組蛋白的生物合成可以選擇原核表達(dá)系統(tǒng)、酵母表達(dá)系統(tǒng)、桿狀病毒-昆蟲細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)、哺乳動物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)等,目標(biāo)蛋白需要用N15和C13標(biāo)記,這使得培養(yǎng)細(xì)菌和細(xì)胞的培養(yǎng)基中不能帶入額外的C源和N源。出于對操作方便性、實(shí)用經(jīng)濟(jì)性、產(chǎn)量高低、技術(shù)難度等多方面考慮,重組蛋白的生物合成以原核表達(dá)系統(tǒng)和酵母表達(dá)系統(tǒng)為主。原核表達(dá)系統(tǒng)中培養(yǎng)大腸桿菌的培養(yǎng)基常用M9葡萄糖礦物培養(yǎng)基,酵母表達(dá)系統(tǒng)中培養(yǎng)畢赤酵母的培養(yǎng)基常用察氏(czapck)培養(yǎng)基,這兩種培養(yǎng)基C源即用C13的單糖或二糖,N源即用含N15的氯化銨或硝酸鈉等,培養(yǎng)條件簡單,產(chǎn)生的標(biāo)記蛋白易純化。(簡易步驟如圖所示)