探針法熒光定量PCR試劑盒制備工藝流程主要包括核酸提取、反轉錄、探針設計合成、反應體系配制以及熒光定量PCR檢測等步驟。具體流程如下:
1.核酸提取
樣本準備:采集目標樣本,如組織、血液或細胞。
RNA 提?。菏褂肣IAGEN RNeasy Mini Kit或其他類似試劑盒,按照說明書進行RNA提取,確保RNA的純度和完整性。
DNA 提?。喝粜鑿臉颖局刑崛NA,采用相應的基因組DNA純化試劑盒進行操作。
2.反轉錄
cDNA 合成:將提取的RNA反轉錄成cDNA,通常使用PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser,此試劑盒包含去除基因組DNA的gDNA Eraser和反轉錄酶。
DNase I處理:在反轉錄前對Total RNA樣品進行DNase I處理,以除去殘存的基因組DNA,避免對后續(xù)實驗造成干擾。
3.探針設計合成
探針設計:根據(jù)目標基因序列設計特異性探針,一般選擇與目標序列匹配的寡核苷酸探針,并在5’端標記熒光報告基團,3’端標記淬滅基團。
探針合成:利用自動化核酸合成儀器進行探針的化學合成,并純化得到的探針以確保其質量。
混合試劑:將PCR酶、dNTPs、緩沖液、Mg??、引物、探針和模板cDNA按比例混合,形成完整的PCR反應體系。
分裝反應液:將混合好的反應液分裝到PCR管或多孔板中,每個反應單元體積一致,確保實驗結果的準確性和重復性。
5.熒光定量PCR檢測
PCR 擴增:在實時熒光定量PCR儀器中進行擴增,通過設定特定的循環(huán)參數(shù)(變性、退火、延伸)來控制PCR過程。
熒光數(shù)據(jù)采集:儀器在每個循環(huán)后自動采集熒光數(shù)據(jù),實時監(jiān)測熒光信號的變化,并根據(jù)Ct值計算初始模板量。
數(shù)據(jù)分析輸出:軟件自動生成擴增曲線和熔解曲線,并進行數(shù)據(jù)分析,輸出檢測結果。